柑橘黑色蒂腐病又稱焦腐病，主要為害貯運期柑橘。成熟的果實采收後2~4周較易發病。
果實腐爛的速度比褐色蒂腐病快，亦能在田間為害枝幹、果實，但不為害青果。是各柑橘種植區常見病害之一。寬皮類橘、甜橙、柚、檸檬均可受害。
柑橘黑色蒂腐病病果
發病癥狀初在果蒂周圍出現水漬狀、柔軟病斑，後迅速擴展，病部果皮暗紫褐色，缺乏光澤，指壓果皮易破裂撕下。
蒂部腐爛後，病菌很快進人果心，並穿過果心引起頂部出現同樣的腐爛癥狀。被害囊瓣與健瓣之間常界線分明。
柑橘黑色蒂腐病病果
爛果常溢出棕褐色黏液，剖開爛果，可見果心和果肉變成黑色，無明顯病斑，最終枯死，其上也密生黑色分生孢子器。枝條被害時呈暗褐色，無明顯病斑，最終枯死，其上也密生黑色分生孢子器。
柑橘遭受凍害、日灼，特別易被此菌寄生而致死。田間的果實一般不發生，除非傷果、蟲果或過熟果。果實成熟後，雖然有時也可被害，但自然著色的果實比用乙烯利人工催熟轉黃的果實發病輕。
柑橘黑色蒂腐病病果
病原病原菌無性態為Botryodiplodia theobromae Pat.，異名Diplodia natalensis Pole-Evans。寄主上的分生孢子器形成較晚，初埋生，後漸突出，單生或聚生，直徑0.8 mm，洋梨形至扁球形，黑色，喙短，有時2~3個生在1個子座內。
分生孢子梗單生，可有隔膜和分枝，產孢細胞圓柱形至近梨形，環痕型，無色，分生孢子頂生，未成熟的孢子單胞，近卵形，無色，壁光滑，內含物往往顆粒狀，基部幾乎平截。
柑橘黑色蒂腐病病果
有時壁較厚，成熟的孢子橢圓形，近橢圓形，雙胞，隔膜處稍縊縮，暗褐色，壁稍厚而平滑，上有縱紋，大小為（21~30）μmx（12~15）μm，分生孢子器內有時有許多側絲。
有性態為phvsalosporarhodina Berk.et Curt.apud Cke，屬子囊菌，Shoemaker將其易名為Botryosphaeria rhodina（Berk.etCurt.）Shoemaker，我國迄今未在柑橘上發現。
此菌在熱帶、亞熱帶地區寄主很多，還為害香蕉、忙果、番木瓜、番石榴、油梨、南瓜、芋頭等，是果蔬貯藏期間主要的病原真菌。
但在北溫帶，致病性很弱，多呈腐生狀態，本菌分生孢子成熟後不易萌發，生長最適溫30C，25C時生長減慢。
柑橘黑色蒂腐病病果
發病規律病菌以菌絲體和分生孢子器在病枯枝及其他病殘余組織上越冬。分生孢子由雨水飛濺到果實上，在萼窪與果皮之間潛伏，或在托盤的壞死組織上腐生，能耐較長時間的幹燥環境。
采後在適宜條件下，由傷口特別是果蒂剪口，或自然脫落的果蒂離層區侵人（一般在離層產生前不能人侵）。一且侵人，發展很快。故貯運期間的病果來自田間，但貯運過程中並不繼續接觸傳播，因為腐爛的病果往往尚未形成孢子。
冬季遭受寒害、栽培管理不善、樹勢衰弱，發病較多；果蒂脫落、果皮受傷的果實容易被害；乙烯脫綠時，用量過大會加速腐爛，溫度28~30℃，果實腐爛迅速，實在逐漸成熟過程中多雨，發病亦較多。
優質不知火柑橘
防治方法①加強田間管理 增強樹勢，避免寒害，早春結合修剪，燒毀病枯枝；采收時，盡量減少和避免產生傷口。
優質豐產柑橘
②藥劑防治 正確使用乙希催熟；采收後，結合防治青、綠莓病，作防腐浸果處理，若能在田間後期噴施1~2次50%多菌靈800~100倍液，可減少貯運期間發病。